جهت عدم تداخل فعالیتهای فوق‌برنامه با برنامه‌های آموزش هفتگی، روزهای پنجشنبه به انجام این مهم اختصاص داده شده است. این روزها با برنامه‌ریزی قبلی و گروه‌بندی و سطح‌بندی دانش‌آموزان در کلاس‌های فوق برنامه المپیاد ریاضی و علوم، تیزهوشان مبتکران، رباتیک، تئاتر، سرود، نرم‌افزارهای کامپیوتر و… در جدول هفتگی گنجانده شده و طبق برنامه انجام می‌گیرد.
از مهمترین برنامه‌های آموزشی دبیرستان آیین، برگزاری کلاس‌های المپیاد ریاضی و علوم تجربی است. جهت‌گیری این کلاس‌ها که طول سال تحصیلی به صورت مستمر تشکیل شده و چندین مرحله آزمون نیز در آن‌ها برنامه‌ریزی شده است، به سوی ارتقاء سطح علمی آموزشگاه خصوصاً دانش‌آموزان مستعد و علاقمند است.
برگزاری کلاس‌های المپیاد دروس پایه‌ای ریاضی و علوم برای موفقیت دانش‌آموزان در آزمون‌های ورودی دبیرستان‌های برتر نقش بسیار مؤثری ایفا می‌کند.
1. برگزاری کلاس المپیاد برای دانش‌آموزان مستعد (سطح 1)
2. برگزاری کلاس‌های تقویتی برای دانش‌آموزان تلاشگر (سطح 2)
3. برگزاری کلاس‌های فرهنگی- هنری
4. برگزاری کارگاه کامپیوتر در سایت کامپیوتر دبیرستان